Pour mener à bien ces différentes missions pour la protection et la valorisation du bassin versant de l'Erdre, la Fédération des Amis de l'Erdre s'appuie sur une équipe de bénévoles actifs, un salarié médiateur de rivière et une animatrice nature.

Le Conseil d'Administration est composé de 12 membres actifs:

- Simon PREVOST, Coprésident

- Jean-Claude HAURAY, Coprésident

- Claude ROUSSELOT, Vice-Président

- Claudine MINIER, Trésorière

- Gael PREVOTEAUX, Vice-trésorier

- Colette HAURAY, Secrétaire

- Laura DEPRIESTER, Vice-secrétaire

- Coline BOBART, Secrétaire, Administratrice

- Lionel JARNOUX, Administrateur

- Guy CROUPY, Administrateur

- Hervé BOCHER, Administrateur

- Clément POTIRON, Administrateur

- Annick VIDAL, Présidente d'honneur

Un poste emploi tremplin a été créé en Avril 2009 pour accompagner les bénévoles et développer les projets de l'association. Clément Amour est médiateur de rivière salarié pour la Fédération des Amis de l'Erdre.

Depuis Décembre 2015, Anna ROGER a rejoint l'équipe FAE et est en charge du pôle animation.

Les permanents sont occasionnellement accompagnés par des stagiaires spécialisés.